RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 VWC2Q2TAL6 325 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 A0A1B0GWJ7 208 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 E7EQL1 145 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FAM222BQ8WU58 562 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 UHRF2Q96PU4 802 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SPG11Q96JI7 2443 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TMEM250H0YL14 139 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 APOA2P02652 100 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRR31Q5SQ13 230 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 OPRK1P41145 380 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RAB31Q13636 194 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SGK494Q96LW2 274 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRO1933Q9H354 126 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 F6UZH7 168 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 KIR2DS2P43631 304 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TMEM178BH3BS89 294 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LINC01551Q86U37 167 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 XKRY2A2RUG3 117 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRSS46E5RG02 174 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 UPK2O00526 184 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LY86O95711 162 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GCHFRP30047 84 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CR1LQ2VPA4 569 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 NABP2Q9BQ15 211 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 H3BTX0 84 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CNTFRP26992 372 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 TCL1AP56279 114 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 OCC1Q8TAD7 63 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RAB9BQ9NP90 201 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRNDQ9UKY0 176 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CXorf1O96002 111 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 STAG3L2P0CL84 134 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 STAG3L3P0CL85 134 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CRYBB3P26998 211 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RND2P52198 227 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 RHOBP62745 196 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 GAMTQ14353 236 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 IMMP2LQ96T52 175 aa14.58□□□□□ -0.07
GRAMD2B-218ENST00000542322 CD24P25063 80 aa14.58□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 FXYD3Q14802 87 aa14.58□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 MORN5Q5VZ52 161 aa14.58□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.58□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAS1LP35410 378 aa14.58□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.58□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 PAX5Q02548 391 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 NUP37Q8NFH4 326 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 OR52E5Q8NH55 327 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 H0YJW9 148 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 MOSP00540 346 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF90Q03938 601 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 MISP3Q96FF7 219 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 RAXQ9Y2V3 346 aa14.57□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 MPDU1O75352 247 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 OR5G3P0C626 314 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRCDQ00LT1 54 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 TOX4O94842 621 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 NBL1P41271 181 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.56□□□□□ -0.08
GRAMD2B-218ENST00000542322 NPIPB3Q92617 1050 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms