RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 ITGB1BP1O14713 200 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 FABP6P51161 128 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TMPRSS3P57727 454 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TREML4Q6UXN2 200 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 C1orf159Q96HA4 380 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 RNF2Q99496 336 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 AHRRA9YTQ3 701 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 CDIPTO14735 213 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 STAG3L2P0CL84 134 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 STAG3L3P0CL85 134 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 GNG3P63215 75 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 Q0VG73 95 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 M0QZ24 198 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 WNT9BO14905 357 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-13P01766 116 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-7P01780 117 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 NTF3P20783 257 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SRIP30626 198 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 AESQ08117 197 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 LTC4SQ16873 150 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 RNF151Q2KHN1 245 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 LEMD1Q68G75 181 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZR03 302 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 RFESDQ8TAC1 157 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 A0A0G2JNJ9 132 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 BMPR1BO00238 502 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SSTR5P35346 364 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 GABRA6Q16445 453 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SVIPQ8NHG7 77 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 Q8TCH9 128 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 KCNS1Q96KK3 526 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 Q9UFV3 132 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ZNF253O75346 499 aa7.51□□□□□ -1.21
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THBS3-211ENST00000541990 WDR31Q8NA23 367 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.51□□□□□ -1.21
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THBS3-211ENST00000541990 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 PROCRQ9UNN8 238 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 CA2P00918 260 aa7.51□□□□□ -1.21
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THBS3-211ENST00000541990 HTD2P86397 168 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 PLP2Q04941 152 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 MSMPQ1L6U9 139 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 RPEL1Q2QD12 228 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 CENPWQ5EE01 88 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZT83 130 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.51□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 GP6Q9HCN6 339 aa7.51□□□□□ -1.21
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THBS3-211ENST00000541990 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ACTL6BO94805 426 aa7.5□□□□□ -1.21
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THBS3-211ENST00000541990 RAC2P15153 192 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 RELBQ01201 579 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 TSKUQ8WUA8 353 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 METRNQ9UJH8 293 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 OR5B21A6NL26 309 aa7.5□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 RNF212BA8MTL3 300 aa7.5□□□□□ -1.21
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