RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 QRFPP83859 136 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCN1Q15293 331 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P2RY14Q15391 338 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BET1LQ9NYM9 111 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSF4Q9ULV5 492 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.06□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HELTA6NFD8 242 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UPK2O00526 184 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFSF12O43508 249 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV2-14P01704 120 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HBE1P02100 147 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCGR3AP08637 254 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABRB1P18505 474 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCKP27707 260 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHRS2Q13268 280 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INSL4Q14641 139 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC23Q5W5X9 447 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF773Q6PK81 442 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCANP1Q8TF63 244 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF141Q8WVD5 230 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MISP3Q96FF7 219 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q96MT0 163 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V0BQ99437 205 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A075B6Q4 140 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BMM0 161 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNG7O60262 68 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNRHRP30968 328 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFAP4P55083 255 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB1P60022 68 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOB3AQ96BX8 217 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POMPQ9Y244 141 aa7.04□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPNT1O95861 308 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRM2P04554 102 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPPCP23582 126 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P2RY1P47900 373 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCN2Q15485 313 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.03□□□□□ -1.28
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087WTM6 91 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PS18 150 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK1P06493 297 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CALB2P22676 271 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASIPP42127 132 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRN3P1Q2M238 152 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM140Q9NV12 185 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.02□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GU03 582 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 I3L2K1 104 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT1C2O00338 296 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT-CO2P00403 227 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DQB1P01920 261 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P0C879 139 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYL12AP19105 171 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP5CP53041 499 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN12P56749 244 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESRGQ1W209 222 aa7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.01□□□□□ -1.29
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