RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TMED6Q8WW62 240 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 BORCS8Q96FH0 119 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 C4orf36Q96KX1 117 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 RARRES2Q99969 163 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 COMMD4Q9H0A8 199 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 FXYD6Q9H0Q3 95 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 AUNIPQ9H7T9 357 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 DIABLOQ9NR28 239 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 RDH8Q9NYR8 311 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 IL20Q9NYY1 176 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 IKZF2Q9UKS7 526 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 S4R3C0 116 aa2.13□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF320A2RRD8 509 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 PLA2G10O15496 165 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ARPC5O15511 151 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 FABP7O15540 132 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SYT7O43581 403 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 LANCL1O43813 399 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC22A5O76082 557 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 NDUFA3O95167 84 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SIX6O95475 246 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 LALBAP00709 142 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 IFNA10P01566 189 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CT45A6P0DMU7 189 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CT45A5P0DMU8 189 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CT45A7P0DMV0 189 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ATF1P18846 271 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 RAB3BP20337 219 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 C4BPBP20851 252 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CBLN1P23435 193 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 HLA-DMAP28067 261 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ETV6P41212 452 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 RBP2P50120 134 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 APOC4P55056 127 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CLDN12P56749 244 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TCTAP57738 103 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 DLK1P80370 383 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 GAGE2BQ13066 116 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 GNMTQ14749 295 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 FXYD3Q14802 87 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 PLGLAQ15195 96 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 PSG5Q15238 335 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 PIGYQ3MUY2 71 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 GAGE2EQ4V326 116 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 HSD17B12Q53GQ0 312 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 RPL39P5Q59GN2 51 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 IGSF11Q5DX21 431 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 UBE2NLQ5JXB2 153 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SFXN4Q6P4A7 337 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 Q6ZSR3 168 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SSX6Q7RTT6 188 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TMED4Q7Z7H5 227 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC35F2Q8IXU6 374 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 Q8IYB0 196 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 PRSS35Q8N3Z0 413 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 C9orf62Q8N4C0 152 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 SUMF2Q8NBJ7 301 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 OR2T33Q8NG76 320 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 OR11H7Q8NGC8 314 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 OR4A5Q8NH83 315 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 THAP6Q8TBB0 222 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ACOT12Q8WYK0 555 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM46BQ96A09 425 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 FGGYQ96C11 551 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 ORAI1Q96D31 301 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CXorf58Q96LI9 332 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 HYLS1Q96M11 299 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 PDCD10Q9BUL8 212 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CHST5Q9GZS9 411 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 CST11Q9H112 138 aa2.12□□□□□ -2.07
CHMP4A-208ENST00000534106 C20orf85Q9H1P6 137 aa2.12□□□□□ -2.07
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