RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ATG12	O94817	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GABARAP	O95166	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	KRAS	P01116	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	IFNA6	P05013	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CLEC3B	P05452	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MYOD1	P15172	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ELK1	P19419	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CBLN1	P23435	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	LPAR6	P43657	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CD81	P60033	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CTF1	Q16619	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	HAGH	Q16775	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TGOLN2	O43493	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	HPGDS	O60760	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	REG1A	P05451	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SERPINE2	P07093	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	LYL1	P12980	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	RPA2	P15927	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GPR183	P32249	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	G6PC	P35575	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCN1-208	ENST00000532474	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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