RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524366.5

GDAP1-208, Transcript of ganglioside induced differentiation associated protein 1, human

TSL 3

Gene GDAP1, Length 583 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GDAP1-208	ENST00000524366	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GDAP1-208	ENST00000524366	TMEM56	Q96MV1	263 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GDAP1-208	ENST00000524366	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
GDAP1-208	ENST00000524366	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GDAP1-208	ENST00000524366	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CSN3	P07498	182 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	FAM209B	Q5JX69	171 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	PRR13	Q9NZ81	148 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CYB5B	O43169	146 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ST8SIA3	O43173	380 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	OR2C1	O95371	312 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CD69	Q07108	199 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SLC35G3	Q8N808	338 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	B9D2	Q9BPU9	175 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	THYN1	Q9P016	225 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366		A0A0B4J293	547 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366		K7EIM0	57 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	B3GALNT1	O75752	331 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ATG12	O94817	140 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	AP3S2	P59780	193 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	OR2C3	Q8N628	320 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	MISP3	Q96FF7	219 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ETV6	P41212	452 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ZNF114	Q8NC26	417 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	OR1P1	Q8NH06	330 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366		A8MWP6	167 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TGOLN2	O43493	480 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CDS2	O95674	445 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	IFNA17	P01571	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CLEC3B	P05452	202 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	AKR1C4	P17516	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	DHODH	Q02127	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TMEM187	Q14656	261 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366		Q6ZRM9	215 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	ZNF320	A2RRD8	509 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	LGALS9	O00182	355 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	NXPH3	O95157	252 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366		Q56UQ5	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	GALNT14	Q96FL9	552 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GDAP1-208	ENST00000524366		I3L2K1	104 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GDAP1-208	ENST00000524366	MT-CO2	P00403	227 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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