RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520577.1

RASA4-208, Transcript of RAS p21 protein activator 4, human

TSL 4

Gene RASA4, Length 542 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASA4-208	ENST00000520577	UCP3	P55916	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577		K7EIM0	57 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	NDUFA4	O00483	81 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	HPGDS	O60760	199 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	RCVRN	P35243	200 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	RORC	P51449	518 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577		K7EMT4	169 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	ADM	P35318	185 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577		Q56UQ5	140 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RASA4-208	ENST00000520577	TSPAN4	O14817	238 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577		M0QYG6	137 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	CTSG	P08311	255 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	FAM25A	B3EWG3	89 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	FAM25C	B3EWG5	89 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	FAM25G	B3EWG6	89 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	TXN2	Q99757	166 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577		I3L2K1	104 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	MFAP4	P55083	255 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	CTF1	Q16619	201 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	AP3S1	Q92572	193 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	JTB	O76095	146 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	PGAM2	P15259	253 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	APOC4	P55056	127 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	RND3	P61587	244 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	YIF1A	O95070	293 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	MT-CO2	P00403	227 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	CD3D	P04234	171 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	PI3	P19957	117 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	PIGP	P57054	158 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577		Q6ZWC4	215 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
RASA4-208	ENST00000520577	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	UBE2C	O00762	179 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	GABARAP	O95166	117 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	TBP	P20226	339 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	RNF2	Q99496	336 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RASA4-208	ENST00000520577	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.01	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms