RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519054.5

SKP1-205, Transcript of S-phase kinase associated protein 1, human

TSL 3

Gene SKP1, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKP1-205	ENST00000519054	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	LTA	P01374	205 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	APOA1	P02647	267 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ZNF3	P17036	446 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	RHOA	P61586	193 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	APOF	Q13790	326 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SSX7	Q7RTT5	188 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	GKN2	Q86XP6	184 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SUN5	Q8TC36	379 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	HBEGF	Q99075	208 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	OR51E2	Q9H255	320 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	FAM206A	Q9NX38	181 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	POMP	Q9Y244	141 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	MYH10	P35580	1976 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054		A0A0J9YX75	114 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	FAM25E	A8MYX2	175 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	UBD	O15205	165 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	FGF16	O43320	207 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	COCH	O43405	550 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	TPM1	P09493	284 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	MT1HL1	P0DM35	61 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SPN	P16150	400 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	CRYGS	P22914	178 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	MP68	P56378	58 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ZNF550	Q7Z398	422 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	DCANP1	Q8TF63	244 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	PSMF1	Q92530	271 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SERPINB11	Q96P15	392 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	OR52B2	Q96RD2	323 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	NABP2	Q9BQ15	211 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	IGSF23	A1L1A6	192 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	FABP7	O15540	132 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	CIAO1	O76071	339 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	CRYBA1	P05813	215 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	PYCR1	P32322	319 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	INPP1	P49441	399 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	RAB2A	P61019	212 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SLAMF1	Q13291	335 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	RAB31	Q13636	194 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	SPERT	Q8NA61	448 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	MRAP2	Q96G30	205 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	FAM210A	Q96ND0	272 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	APOL4	Q9BPW4	351 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ACBD6	Q9BR61	282 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	MED18	Q9BUE0	208 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		0.9	□□□□□ -2.26
SKP1-205	ENST00000519054	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	IQCF5	A8MTL0	148 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054		A8MWP6	167 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054		K7ERQ8	282 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	GPR171	O14626	319 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	ZW10	O43264	779 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	UQCRH	P07919	91 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	LIMS3	P0CW19	117 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	LIMS4	P0CW20	117 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	NQO2	P16083	231 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	UGT2B10	P36537	528 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	OR4D1	Q15615	310 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	OR8G1	Q15617	311 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SKP1-205	ENST00000519054	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27

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