RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	IL9	P15248	144 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LMO1	P25800	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	PSG5	Q15238	335 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	NMB	P08949	121 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LINC00869	P0C866	280 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	CKS2	P33552	79 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LYZ	P61626	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467		E9PQ18	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	AGPAT2	O15120	278 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF253	O75346	499 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LTC4S	Q16873	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467		M0R2Z0	102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TIMM23	O14925	209 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	CDA	P32320	146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	C3AR1	Q16581	482 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	CCL25	O15444	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FGF16	O43320	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	PGF	P49763	221 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TIMP4	Q99727	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FABP2	P12104	132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	CCL2	P13500	99 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	PLN	P26678	52 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	EFNB2	P52799	333 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FOXC2	Q99958	501 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	APOM	O95445	188 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ADRA2A	P08913	450 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LYL1	P12980	280 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FOXL1	Q12952	345 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	HCST	Q9UBK5	93 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FAM221A	A4D161	298 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TRGC2	P03986	189 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	CCL20	P78556	96 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	TGFBR1	P36897	503 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467		Q8NFD4	153 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PTPN13-209	ENST00000511467	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	THY1	P04216	161 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	WNT1	P04628	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	LOXL3	P58215	753 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	METRN	Q9UJH8	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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