RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ABCA1O95477 2261 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 REG1BP48304 166 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 RPP30P78346 268 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 SCNM1Q9BWG6 230 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 M0R143 59 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 FAM87AP0C7U9 286 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 OR51B2Q9Y5P1 312 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 COL6A6A6NMZ7 2263 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa10.49□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 TBX15Q96SF7 602 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 DERL1Q9BUN8 251 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.49□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZVH6 145 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 TMEM18Q96B42 140 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ENY2Q9NPA8 101 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ZNF835Q9Y2P0 537 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 LINC00312Q9Y6C7 94 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 E7EQL1 145 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 PPIAL4DF5H284 164 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 J3QR06 171 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 NDUFB4O95168 129 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 PPIAL4FP0DN26 164 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 CDKN1AP38936 164 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.48□□□□□ -0.73
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PRAME-213ENST00000492657 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 MPDU1O75352 247 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 FOXH1O75593 365 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 GCGP01275 180 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 IQCJQ1A5X6 159 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-213ENST00000492657 TMEM106BQ9NUM4 274 aa10.47□□□□□ -0.73
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