RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	ATG12	O94817	140 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	CDS2	O95674	445 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	ZP3	P21754	424 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	MAS1L	P35410	378 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	CD81	P60033	236 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM3-208	ENST00000489344	MUC4	Q99102	2169 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SNAPC5	O75971	98 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TCRB	P04435	133 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	ANXA3	P12429	323 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM187	Q14656	261 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM56	Q96MV1	263 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TSC22D3	Q99576	134 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TRGV3	P03979	118 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	HLA-G	P17693	338 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	VAMP1	P23763	118 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	AKR1C2	P52895	323 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	PHB2	Q99623	299 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344		E7EUB6	86 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SFT2D2	O95562	160 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	FGF2	P09038	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	MYOD1	P15172	320 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	DEFA1	P59665	94 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	DEFA3	P59666	94 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	LGI3	Q8N145	548 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	OR4A16	Q8NH70	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	IL22RA2	Q969J5	263 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	PRR13	Q9NZ81	148 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	CSN3	P07498	182 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	OR4E1	P0C645	316 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	SRPX	P78539	464 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	CD7	P09564	240 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344		P0C879	139 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM3-208	ENST00000489344	APELA	P0DMC3	54 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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