RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NPFFO15130 113 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF616Q08AN1 781 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLRD1Q13241 179 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MMDQ15546 238 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HCP5Q6MZN7 132 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NPBQ8NG41 125 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CXorf58Q96LI9 332 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TBX15Q96SF7 602 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM157AC9JC47 383 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 I3L521 148 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 J3QLI3 93 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CNIH1O95406 144 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CA2P00918 260 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGKV1D-33P01593 117 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGKV1-33P01594 117 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BPIFB3P59826 476 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARL16Q0P5N6 197 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TNXAQ16473 311 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AANATQ16613 207 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BTNL8Q6UX41 500 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HAPLN4Q86UW8 402 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q96MF0 132 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HRH4Q9H3N8 390 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CRYGBP07316 175 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AKR1C1Q04828 323 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TEPPQ6URK8 271 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CFHR4Q92496 578 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C1orf159Q96HA4 380 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC35E1Q96K37 410 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDUFA3O95167 84 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LY6G6DO95868 133 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGHV1-69P01742 117 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OPN1MWP04001 364 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM11P17152 192 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DLX1P56177 255 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GNB1P62873 340 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EBI3Q14213 229 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PEA15Q15121 130 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BSXQ3C1V8 233 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TEX29Q8N6K0 151 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF114Q8NC26 417 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1W2PRD5 423 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1W2PRF3 423 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1W2PRM7 423 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IFNA1P01562 189 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OR13C7P0DN81 318 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SAA4P35542 130 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RUNX1Q01196 453 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LYPD6BQ8NI32 183 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FBXL15Q9H469 300 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C7orf69Q9H7B7 122 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A096LNT2 108 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OPRK1P41145 380 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OR1P1Q8NH06 330 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RSG1Q9BU20 258 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCGB2A1O75556 95 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT-CO2P00403 227 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms