RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	SNAPIN	O95295	136 aa		14.71	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	BTN1A1	Q13410	526 aa		14.71	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	ATRAID	Q6UW56	229 aa		14.71	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		14.71	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	FBXL15	Q9H469	300 aa		14.71	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		14.71	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	TNC	P24821	2201 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	OOSP1	A8MZH6	123 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	IFNA1	P01562	189 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	WT1-AS	Q06250	92 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SSX2	Q16385	188 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	HES1	Q14469	280 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	MMD	Q15546	238 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	CFHR4	Q92496	578 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	ZFP92	A6NM28	416 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	MOS	P00540	346 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	CD69	Q07108	199 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	MIC13	Q5XKP0	118 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC35E1	Q96K37	410 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230		A1L4Q6	167 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	KHDC3L	Q587J8	217 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1W2PPV4	95 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	ICAM4	Q14773	271 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	RAB24	Q969Q5	203 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	P2RX4	Q99571	388 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	NBR2	O15453	112 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	REG1A	P05451	166 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	UBE2E1	P51965	193 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	B2M	P61769	119 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	14.67	□□□□□ -0.06	7e-11	■□□□□ 10.2
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SUN5	Q8TC36	379 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	PERP	Q96FX8	193 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	TBX15	Q96SF7	602 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	BCL2	P10415	239 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	PAX6	P26367	422 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	GAMT	Q14353	236 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	CEBPG	P53567	150 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	C1orf159	Q96HA4	380 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	YIF1A	O95070	293 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	CNIH1	O95406	144 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	CD24	P25063	80 aa		14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	VWC2L	B2RUY7	222 aa		14.65	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		14.65	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	MLANA	Q16655	118 aa		14.65	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		14.65	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	STPG3	Q8N7X2	389 aa		14.65	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	ACY3	Q96HD9	319 aa		14.65	□□□□□ -0.06
GCFC2-208	ENST00000472230	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	NPB	Q8NG41	125 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	MALSU1	Q96EH3	234 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	VAX2	Q9UIW0	290 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	FCN1	O00602	326 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	APELA	P0DMC3	54 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFA4	P12838	97 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	NPBWR1	P48145	328 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFA3	O95167	84 aa		14.63	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	AREG	P15514	252 aa		14.63	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	OR10J1	P30954	320 aa		14.63	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	PMS2P11	Q13670	270 aa		14.63	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF114	Q8NC26	417 aa		14.63	□□□□□ -0.07
GCFC2-208	ENST00000472230	MISP3	Q96FF7	219 aa		14.63	□□□□□ -0.07

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