RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-208ENST00000472230 SNAPINO95295 136 aa14.71□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.71□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 FBXL15Q9H469 300 aa14.71□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.71□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.69□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 SLC35E1Q96K37 410 aa14.69□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 A1L4Q6 167 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 KHDC3LQ587J8 217 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.68□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 A0A1W2PPV4 95 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 ICAM4Q14773 271 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.68□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 RAB24Q969Q5 203 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 P2RX4Q99571 388 aa14.68□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 NBR2O15453 112 aa14.67□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 REG1AP05451 166 aa14.67□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 UBE2E1P51965 193 aa14.67□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.067e-11■□□□□ 10.2
GCFC2-208ENST00000472230 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.67□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 PERPQ96FX8 193 aa14.67□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.67□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 CEBPGP53567 150 aa14.66□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.66□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 C1orf159Q96HA4 380 aa14.66□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.66□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.66□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 YIF1AO95070 293 aa14.66□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 CNIH1O95406 144 aa14.66□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.65□□□□□ -0.06
GCFC2-208ENST00000472230 MLANAQ16655 118 aa14.65□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 ACY3Q96HD9 319 aa14.65□□□□□ -0.06
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GCFC2-208ENST00000472230 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.64□□□□□ -0.07
GCFC2-208ENST00000472230 NPBQ8NG41 125 aa14.64□□□□□ -0.07
GCFC2-208ENST00000472230 MALSU1Q96EH3 234 aa14.64□□□□□ -0.07
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GCFC2-208ENST00000472230 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.64□□□□□ -0.07
GCFC2-208ENST00000472230 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.64□□□□□ -0.07
GCFC2-208ENST00000472230 NDUFA3O95167 84 aa14.63□□□□□ -0.07
GCFC2-208ENST00000472230 AREGP15514 252 aa14.63□□□□□ -0.07
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GCFC2-208ENST00000472230 MISP3Q96FF7 219 aa14.63□□□□□ -0.07
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