RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364		Q6ZRG5	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	LHX4	Q969G2	390 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	HARBI1	Q96MB7	349 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	C16orf95	Q9H693	158 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A0U1RQK1	487 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	LY6L	H3BQJ8	138 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	KBTBD11	O94819	623 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	MC5R	P33032	325 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	RUNX1	Q01196	453 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	HCP5	Q6MZN7	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364		Q6ZSV7	163 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	TNC	P24821	2201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	NUDT19	A8MXV4	375 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	CAMLG	P49069	296 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB5C	P51148	216 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB13	P51153	203 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	KLRD1	Q13241	179 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	MARC2	Q969Z3	335 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB19	A4D1S5	217 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	ODF3B	A8MYP8	253 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	IFNA10	P01566	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	PRCD	Q00LT1	54 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	RPE	Q96AT9	228 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1W2PPI3	338 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	RRH	O14718	337 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	TSPAN9	O75954	239 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	PRH1	P02810	166 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	FBP1	P09467	338 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	ZP3	P21754	424 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	FHIT	P49789	147 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	RITA1	Q96K30	269 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	RSG1	Q9BU20	258 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RUBCN-208	ENST00000471364	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		10.08	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms