RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TIAF1	O95411	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		Q6ZS52	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		F8WDY8	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		H3BP45	60 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CRYAA	P02489	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	GATA3	P23771	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PRTN3	P24158	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	LHX2	P50458	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	LINC01565	O15544	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CXorf1	O96002	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MUC4	Q99102	2169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		F5H768	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	NGF	P01138	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	HTN1	P15515	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ACP1	P24666	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	UNC119	Q13432	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CFP	P27918	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FGF12	P61328	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PMVK	Q15126	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PAGE4	O60829	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FCGR3B	O75015	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	WFDC2	Q14508	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TWIST1	Q15672	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CDKN1A	P38936	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	APOM	O95445	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CCL1	P22362	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CA6	P23280	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ABCA3	Q99758	1704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MFAP2	P55001	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	DNAL4	O96015	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MT-ND6	P03923	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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