RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-208	ENST00000450875	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CCR6	P51684	374 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SLURP1	P55000	103 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SRPX	P78539	464 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	FHL3	Q13643	280 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	RPEL1	Q2QD12	228 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF429	Q86V71	674 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	LGI3	Q8N145	548 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	DCUN1D4	Q92564	292 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM230	Q96A57	120 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	GALNT14	Q96FL9	552 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CXorf58	Q96LI9	332 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PLXNB1	O43157	2135 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SAP30	O75446	220 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	NDUFB8	O95169	186 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	IGHV3-23	P01764	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SNCA	P37840	140 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PRCD	Q00LT1	54 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	WT1-AS	Q06250	92 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM187	Q14656	261 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SPINK9	Q5DT21	86 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	IL22RA2	Q969J5	263 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	OR4C12	Q96R67	309 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PRR13	Q9NZ81	148 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875		S4R3C0	116 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0B4J293	547 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	ST8SIA3	O43173	380 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	ARL3	P36405	182 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	INSL3	P51460	131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SYNJ2BP	P57105	145 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF846	Q147U1	533 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	GPR146	Q96CH1	333 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	MISP3	Q96FF7	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PEMT	Q9UBM1	199 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CACNG5	Q9UF02	275 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0B4J2A0	478 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0G2JRQ6	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	LYRM1	O43325	122 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	NDUFB6	O95139	128 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	NXPH3	O95157	252 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SFT2D2	O95562	160 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	TRBV12-3	P01733	135 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SPCS3	P61009	180 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PPP1R1A	Q13522	171 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875		Q56UQ5	140 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	PLET1	Q6UQ28	207 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	OR2C3	Q8N628	320 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	OR1P1	Q8NH06	330 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	OR52E5	Q8NH55	327 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	OR1S1	Q8NH92	325 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CITED1-208	ENST00000450875	COQ8A	Q8NI60	647 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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