RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-202ENST00000444658 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIAA1456Q9P272 454 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-202ENST00000444658 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.4□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPS13CQ709C8 3753 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 NBR2O15453 112 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACTL6BO94805 426 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 MBP02144 154 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 APOC3P02656 99 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SAA4P35542 130 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF616Q08AN1 781 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-202ENST00000444658 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TREM1Q9NP99 234 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 F8W036 122 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNAPINO95295 136 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV1D-33P01593 117 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV1-33P01594 117 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPY1RP25929 384 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 GUK1Q16774 197 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q5PR19 223 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEX29Q8N6K0 151 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CGB1A6NKQ9 187 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 E7EUB6 86 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CA2P00918 260 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-202ENST00000444658 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MMDQ15546 238 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-202ENST00000444658 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ARID1AO14497 2285 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TENM4Q6N022 2769 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPG11Q96JI7 2443 aa7.37□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CORTO00230 105 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TGFAP01135 160 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRYGCP07315 174 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNTFRP26992 372 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 FHITP49789 147 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 RUNX1Q01196 453 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 WT1-ASQ06250 92 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPINK9Q5DT21 86 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR1P1Q8NH06 330 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBXL15Q9H469 300 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PRD5 423 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PRF3 423 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PRM7 423 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEX22C9J3V5 150 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 FCN1O00602 326 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DRB1P01911 266 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBP1P09467 338 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SFTA3P0C7M3 94 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR13C7P0DN81 318 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM11P17152 192 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADCYAP1P18509 176 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFA5Q01523 94 aa7.36□□□□□ -1.23
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