RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 REG4Q9BYZ8 158 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 H3BQ85 93 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TNFSF13O75888 250 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SFTA2Q6UW10 78 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 MESP1Q9BRJ9 268 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 EPDR1Q9UM22 224 aa5.96□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GAGE10A6NGK3 116 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 HSD52Q0P140 79 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 MIC13Q5XKP0 118 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GGNQ86UU5 652 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 C11orf52Q96A22 123 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RAB37Q96AX2 223 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GFI1Q99684 422 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 OR11H12B2RN74 326 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SHISA9B4DS77 424 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 COX6B1P14854 86 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CX3CL1P78423 397 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 OR11H1Q8NG94 326 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 OR11H2Q8NH07 326 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 C16orf92Q96LL3 132 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GUCD1Q96NT3 240 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CCL21O00585 134 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 EFNB3Q15768 340 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TAL2Q16559 108 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 WDR82Q6UXN9 313 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 BLNKQ8WV28 456 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00477Q96M19 166 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV1-2P23083 117 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 WFDC6Q9BQY6 131 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 C3orf80F5H4A9 247 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 FXYD3Q14802 87 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LYZL4Q96KX0 146 aa5.95□□□□□ -1.46
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ALMS1-201ENST00000423048 CITED1Q99966 193 aa5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GPX1P07203 203 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GLI4P10075 376 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 COX7A1P24310 79 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 NMUP48645 174 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 H0YIZ8 118 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 HBDP02042 147 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 OR9G9P0C7N8 305 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 CAMPP49913 170 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PSG7Q13046 419 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 BMPERQ8N8U9 685 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RFNGQ9Y644 331 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PP11 408 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 J3QLI3 93 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 GDF9O60383 454 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LTBRP36941 435 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 RTP5Q14D33 572 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 TEX38Q6PEX7 206 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PRNTQ86SH4 94 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ISOC2Q96AB3 205 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV3-15P01624 115 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV2-70P01814 119 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 LOXL3P58215 753 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 ARF6P62330 175 aa5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ALMS1-201ENST00000423048 FOXC1Q12948 553 aa5.94□□□□□ -1.46
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