RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 RABAC1Q9UI14 185 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FADS6Q8N9I5 356 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 GPR82Q96P67 336 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PSMG4Q5JS54 123 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 GBF1Q92538 1859 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TMEM262E9PQX1 116 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TDGF1P13385 188 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 GAGE1Q13065 139 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 HBDP02042 147 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 GUSBP1Q15486 140 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CT55Q8WUE5 264 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TMEM54Q969K7 222 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 WNT9BO14905 357 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PTGDSP41222 190 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CCL8P80075 99 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PSG9Q00887 426 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 KIR3DS1Q14943 382 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 WDR82Q6UXN9 313 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 OR52E5Q8NH55 327 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FMC1Q96HJ9 113 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 C16orf92Q96LL3 132 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 A8MWV9 139 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CD5LO43866 347 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 LYL1P12980 280 aa8.24□□□□□ -1.09
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HERC3-202ENST00000402738 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 AGMATQ9BSE5 352 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 RAMP3O60896 148 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-39P01824 125 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PQF6 199 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3-11P04433 115 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.23□□□□□ -1.09
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 A0A0G2JMM0 328 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPB8 328 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 EFNB3Q15768 340 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 LYZL4Q96KX0 146 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CHODLQ9H9P2 273 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GW15 77 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SYNGR3O43761 229 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PYYP10082 97 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 DPM2O94777 84 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3-15P01624 115 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SPINK8P0C7L1 97 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PRTN3P24158 256 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FAM166AQ6J272 317 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TSKUQ8WUA8 353 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 KIR2DL4Q99706 377 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 Q9H3A6 140 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 C1RLQ9NZP8 487 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 DNAL4O96015 105 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ERVK11-1P61568 191 aa8.22□□□□□ -1.09
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