RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 VAX2Q9UIW0 290 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PPI3 338 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFS7O75251 213 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 FOXH1O75593 365 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PSMB3P49720 205 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CD69Q07108 199 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PSG5Q15238 335 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PRSS8Q16651 343 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RAB24Q969Q5 203 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RARRES2Q99969 163 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.96□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 RELNP78509 3460 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 CACNA1BQ00975 2339 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFS8O00217 210 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 CORTO00230 105 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 MT-CO2P00403 227 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 CRYGBP07316 175 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 OR13C7P0DN81 318 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 LGALS4P56470 323 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 B2MP61769 119 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 PLGLAQ15195 96 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 RHEBQ15382 184 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TNXAQ16473 311 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SSX7Q7RTT5 188 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF114Q8NC26 417 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 NANPQ8TBE9 248 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.96□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 M0R036 132 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TSPAN4O14817 238 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TIMM23O14925 209 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 VENTXO95231 258 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 NPBWR1P48145 328 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 DLX1P56177 255 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 RHOBP62745 196 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 STPG3Q8N7X2 389 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 MDFIQ99750 246 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.95□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 USP24Q9UPU5 2620 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 MOSP00540 346 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV4-39P01824 125 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 WT1-ASQ06250 92 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 MMDQ15546 238 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 AWAT1Q58HT5 328 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 MIC13Q5XKP0 118 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 FAM168AQ92567 244 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SIRPDQ9H106 197 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.94□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 CGB1A6NKQ9 187 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 FAM74A7A6NL05 159 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM250H0YL14 139 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 NBR2O15453 112 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 TOX4O94842 621 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 YIF1AO95070 293 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 CXorf1O96002 111 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 CEBPGP53567 150 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 LMO4P61968 165 aa8.93□□□□□ -0.98
CTXN3-202ENST00000395322 LCN2P80188 198 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms