RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 DBX1A6NMT0 343 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SFT2D2O95562 160 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLL1P15814 213 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 WT1-ASQ06250 92 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TATDN3Q17R31 274 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WW49 117 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G10O15496 165 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ST8SIA3O43173 380 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFB8O95169 186 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SNCAP37840 140 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SPCS3P61009 180 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2C3Q8N628 320 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1P1Q8NH06 330 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52E5Q8NH55 327 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNG5Q9UF02 275 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 G3V4G9 280 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 OVOL1O14753 267 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFA5Q01523 94 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R1AQ13522 171 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 AARDQ4LEZ3 155 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 LRTM2Q8N967 370 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 DCUN1D4Q92564 292 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR146Q96CH1 333 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0G2JRQ6 117 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 UPK1BO75841 260 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 BTCP35070 178 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 INSL3P51460 131 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SLURP1P55000 103 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 RPEL1Q2QD12 228 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZRM9 215 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 C1QL4Q86Z23 238 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR13Q9NZ81 148 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SORL1Q92673 2214 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GU03 582 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TCRBP04435 133 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4E1P0C645 316 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ASAH1Q13510 395 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SMCO1Q147U7 214 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 C4orf46Q504U0 113 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 NMSQ5H8A3 153 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF114Q8NC26 417 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 COQ8AQ8NI60 647 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf170A2RU37 121 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A6P12236 298 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINK9Q5DT21 86 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 LYG2Q86SG7 212 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1S1Q8NH92 325 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V0BQ99437 205 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CORTO00230 105 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNA21P01568 189 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC3BP05452 202 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL3P36405 182 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 DHRS2Q13268 280 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 NOXA1Q86UR1 476 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 MISP3Q96FF7 219 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4C12Q96R67 309 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 HIPK2Q9H2X6 1198 aa11.82□□□□□ -0.52
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