RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 TEPPQ6URK8 271 aa9.98□□□□□ -0.81
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ZNF548-201ENST00000336128 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 BCL2P10415 239 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 CD69Q07108 199 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-201ENST00000336128 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.98□□□□□ -0.81
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ZNF548-201ENST00000336128 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.97□□□□□ -0.81
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ZNF548-201ENST00000336128 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
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ZNF548-201ENST00000336128 PRR20BP86481 221 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-201ENST00000336128 PRR20AP86496 221 aa9.95□□□□□ -0.82
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ZNF548-201ENST00000336128 TEX22C9J3V5 150 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFS8O00217 210 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00869P0C866 280 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-201ENST00000336128 COX6B1P14854 86 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-201ENST00000336128 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-201ENST00000336128 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.94□□□□□ -0.82
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ZNF548-201ENST00000336128 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.94□□□□□ -0.82
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