RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 WDR82Q6UXN9 313 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 RTTNQ86VV8 2226 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV3P03979 118 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 LHX2P50458 406 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01560Q8TB33 94 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 LYZL4Q96KX0 146 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 CHODLQ9H9P2 273 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IZUMO1RA6ND01 250 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 GAS1P54826 345 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 CSRP2Q16527 193 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL7Q9UJT9 491 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 DUX5Q96PT3 197 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 APOHP02749 345 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 OTOFQ9HC10 1997 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 CCL20P78556 96 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 WNT10AQ9GZT5 417 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 H7C1H1 209 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 EFEMP2O95967 443 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 LTBRP36941 435 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 NEUROG1Q92886 237 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 UPK2O00526 184 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF497Q6ZNH5 498 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 TTC9CQ8N5M4 171 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM160Q9NX00 188 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf100A8MU93 164 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ASIPP42127 132 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 MEIG1Q5JSS6 88 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 GFI1Q99684 422 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM4O75871 244 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-33P01593 117 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-33P01594 117 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB1A1P11684 91 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM13Q9H4Q3 707 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 CEP250Q9BV73 2442 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WV48 116 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JLM5 398 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 BSPH1Q075Z2 132 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM170AQ8WVE7 144 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf61A6NNL5 157 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 CELA3BP08861 270 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC1AQ92747 370 aa17.71■□□□□ 0.43
CCSAP-201ENST00000284617 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CRIPAKQ8N1N5 446 aa17.71■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF319Q9P2F9 582 aa17.71■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf144Q96I85 54 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 Q9H3A6 140 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R27Q86WC6 154 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 PATJQ8NI35 1801 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 ORMDL3Q8N138 153 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf15Q96N68 181 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf106Q8NAJ2 232 aa17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 M0R381 172 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 TCF23Q7RTU1 214 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 OTORQ9NRC9 128 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 ESPL1Q14674 2120 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 MORN2Q502X0 79 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM170BQ5T4T1 132 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa17.69■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 HIGD1CA8MV81 97 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRE2 83 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 FAM181BA6NEQ2 426 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 OSTCQ9NRP0 149 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 NPFFO15130 113 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A6YYD4 124 aa17.68■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CRYGSP22914 178 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 GPR183P32249 361 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 MBD3L1Q8WWY6 194 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 TET1Q8NFU7 2136 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1EQ15878 2313 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SIPA1L1O43166 1804 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 C9JCJ5 164 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CCL19Q99731 98 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB3A1Q96QR1 104 aa17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms