RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 EDDM3AQ14507 147 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 VWC2Q2TAL6 325 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 AARDQ4LEZ3 155 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZR03 302 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ISOC2Q96AB3 205 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF665Q9H7R5 613 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 MSL2Q9HCI7 577 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ESM1Q9NQ30 184 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF7Q9UBF6 113 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP13Q9UII6 198 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPV4 95 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 C15orf65H3BRN8 121 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R1X1 148 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R2P9O14990 202 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE6DO43924 150 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FCGR3BO75015 233 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 KBTBD11O94819 623 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNA10P01566 189 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV2-5P01817 119 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RND2P52198 227 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 MORN2Q502X0 79 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CD177Q8N6Q3 437 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB1CQ92928 201 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM210BQ96KR6 192 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2V2Q96R30 315 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CALYQ9NYX4 217 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CLN8Q9UBY8 286 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IL19Q9UHD0 177 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FZR1Q9UM11 496 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RFNGQ9Y644 331 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FNDC10F2Z333 226 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 H7BYZ3 331 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RAMP3O60896 148 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF1AP19438 455 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXA5P20719 270 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CD1BP29016 333 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ADMP35318 185 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SSTR5P35346 364 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OPRK1P41145 380 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 EDDM3BP56851 147 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 HNF4GQ14541 408 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOBQ15370 118 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ADIRFQ15847 76 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF726P1Q15940 193 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX2Q16385 188 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 BSXQ3C1V8 233 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 LCE4AQ5TA78 99 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4F5Q8NH21 305 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 RFESDQ8TAC1 157 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SDSLQ96GA7 329 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 YPEL4Q96NS1 127 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 DUX5Q96PT3 197 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4F4Q96R69 305 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX3Q99909 188 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 PRNDQ9UKY0 176 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms