RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 AUP1Q9Y679 476 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 C9JCJ5 164 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 KLK2P20151 261 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1D-33P01593 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-33P01594 117 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 GATA3P23771 443 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 FAM27E3Q08E93 113 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 PRSS8Q16651 343 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 DPRXA6NFQ7 191 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00587B1AMM8 73 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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