RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PAX5Q02548 391 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 HBZP02008 142 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ADH4P08319 380 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 SMR3AQ99954 134 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA1O95477 2261 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf98A8MV24 154 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 CD1BP29016 333 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 TMUB1Q9BVT8 246 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 BPESC1Q9GZL8 116 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GWJ7 208 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPV4 95 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 NPPCP23582 126 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 OPRK1P41145 380 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM78BQ5VT40 261 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 UBALD1Q8TB05 177 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A096LNT2 108 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL17Q92583 94 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf30Q96GV9 206 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP11Q9NYL4 201 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNL4K9M1U5 179 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT9BO14905 357 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 BRWD1-AS2P59051 145 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVFC1-1P60608 527 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 GNB1P62873 340 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52E5Q8NH55 327 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFHX3Q15911 3703 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0U1RQK1 487 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF320A2RRD8 509 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 VWC2LB2RUY7 222 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PSPNO60542 156 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf194Q5T5A4 169 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N7P7 452 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52L2PQ8NGH6 319 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC16Q969W1 377 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 IL19Q9UHD0 177 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf62A8K5M9 175 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10J1P30954 320 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA7P36544 502 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 SFRP2Q96HF1 295 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA2Q9BZC7 2435 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 TANC2Q9HCD6 1990 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH11A6NNE9 402 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 HTD2P86397 168 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 NEU1Q99519 415 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 GCM1Q9NP62 436 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf80F5H4A9 247 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf1O96002 111 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 BTNL3Q6UXE8 466 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 SELLP14151 372 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 CST9LP1Q5W188 147 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TCAPO15273 167 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFB4O95168 129 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 GRPP07492 148 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF4P23510 183 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 DSCR9P59020 149 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 PAFAH1B2P68402 229 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF124Q15973 351 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DL5AQ8N109 375 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 LY96Q9Y6Y9 160 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOTP62341 195 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 MOGAT3Q86VF5 341 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 R3HDM4Q96D70 268 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 PIMREGQ9BSJ6 248 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 NAGKQ9UJ70 344 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SONP18583 2426 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R143 59 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINT2O43291 252 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 HPRT1P00492 218 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 STAG3L2P0CL84 134 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 STAG3L3P0CL85 134 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ACP7Q6ZNF0 438 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QZK8 103 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB1D1O95968 90 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 AESQ08117 197 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM201AQ5SY85 155 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF826PQ6ZT77 177 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SGMS2Q8NHU3 365 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 COQ2Q96H96 371 aa21.43■■□□□ 1.02
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