RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 KLF4O43474 513 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CECR9P0C854 216 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 C9orf106Q8NAJ2 232 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 MBD3L1Q8WWY6 194 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ASCL4Q6XD76 172 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 TMEM54Q969K7 222 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 LRTM2Q8N967 370 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 A0A1B0GWB2 263 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 MSGN1A6NI15 193 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 IGHV4-39P01824 125 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 VCX2Q9H322 139 aa11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 A0A1B0GV72 72 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SAP30O75446 220 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 GHRHP01286 108 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 UMODP07911 640 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 RIPPLY3P57055 190 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SFTA2Q6UW10 78 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CST9LQ9H4G1 147 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CD59P13987 128 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CD33P20138 364 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ZNF79Q15937 498 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 PAX1P15863 534 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 IFI27L2Q9H2X8 130 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 WDR90Q96KV7 1748 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CA7P43166 264 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 FBLN7Q53RD9 439 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 TMEM50AO95807 157 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CGAP01215 116 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 COX5BP10606 129 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CBLN1P23435 193 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 EFNB1P98172 346 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 IGFBP2P18065 325 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CXCL2P19875 107 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 RND3P61587 244 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 A0A087WX48 190 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 LEMD1Q68G75 181 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 FAM206AQ9NX38 181 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 ERVK11-1P61568 191 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 SMIM8Q96KF7 97 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 CACNA1BQ00975 2339 aa11.34□□□□□ -0.59
TMX4-201ENST00000246024 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 PAX2Q02962 417 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 TCF23Q7RTU1 214 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 LEPP41159 167 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 LHX2P50458 406 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 GZMMP51124 257 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 OR52E5Q8NH55 327 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 Q96M66 194 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 OTOFQ9HC10 1997 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 ZNF585BQ52M93 769 aa11.33□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 NCOR1O75376 2440 aa11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 CBLN4Q9NTU7 201 aa11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 PINLYPA6NC86 204 aa11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 LINC00614P0C842 121 aa11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 ST20Q9HBF5 79 aa11.32□□□□□ -0.6
TMX4-201ENST00000246024 LTBP1Q14766 1721 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms