RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MMP9P14780 707 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OPRK1P41145 380 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PAX2Q02962 417 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF726P1Q15940 193 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 GUCA2BQ16661 112 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LEMD1Q68G75 181 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ATP5SQ99766 215 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IFNA5P01569 189 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SPP1P10451 314 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 BLCAPP62952 87 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PSG5Q15238 335 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 Q5PR19 223 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ENY2Q9NPA8 101 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SPCS3P61009 180 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ECSCRQ19T08 205 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MORN5Q5VZ52 161 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 NPIPB3Q92617 1050 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SIRPDQ9H106 197 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 GNG13Q9P2W3 67 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PPE2 198 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PR64 198 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PRV1 198 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TSPAN15O95858 294 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ADCYAP1P18509 176 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CD1BP29016 333 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TREML4Q6UXN2 200 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF596Q8TC21 504 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SMIM8Q96KF7 97 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR10J4P0C629 311 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SGK494Q96LW2 274 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR5B12Q96R08 314 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 P2RX4Q99571 388 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF329Q86UD4 541 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CFHR4Q92496 578 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.24□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FOXH1O75593 365 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CX3CL1P78423 397 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 BTN1A1Q13410 526 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF266Q14584 549 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RAB39BQ96DA2 213 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ASCL2Q99929 193 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00862A6NCI5 91 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 H3BUX3 64 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SULT1A2P50226 295 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HBG1P69891 147 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HBG2P69892 147 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PARP11Q9NR21 331 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LY6LH3BQJ8 138 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM11P17152 192 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RND2P52198 227 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R30P59541 319 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FXYD3Q14802 87 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS8Q16651 343 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM177Q53S58 311 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 AJUBAQ96IF1 538 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MGST2Q99735 147 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR10J1P30954 320 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 GAMTQ14353 236 aa5.23□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms