RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 CXCL1P09341 107 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 LYNX1P0DP58 116 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SFTPCP11686 197 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 COL8A2P25067 703 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PLA2G5P39877 138 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 LGALS7P47929 136 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ATP5G3P48201 142 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PRR20EP86478 221 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PRR20CP86479 221 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PRR20DP86480 221 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PRR20BP86481 221 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PRR20AP86496 221 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CD69Q07108 199 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 FAM210BQ96KR6 192 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MIOXQ9UGB7 285 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TNCP24821 2201 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 IGF2RP11717 2491 aa6.7□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 AP4M1O00189 453 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CLN5O75503 358 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 S100A8P05109 93 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 GCHFRP30047 84 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TAS2R45P59539 299 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 FAM78BQ5VT40 261 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C1orf159Q96HA4 380 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 IGLV2-23P01705 113 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 COX7A1P24310 79 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR10J1P30954 320 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 GAMTQ14353 236 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MMD2Q8IY49 270 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 RPEQ96AT9 228 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 FAM122AQ96E09 287 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ACY3Q96HD9 319 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 UHRF2Q96PU4 802 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 FUT9Q9Y231 359 aa6.69□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 LIPFP07098 398 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 GALR1P47211 349 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 GNB1P62873 340 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MOB3BQ86TA1 216 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 DOK5Q9P104 306 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 NDUFB4O95168 129 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 IGLV1-47P01700 117 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV2-5P01817 119 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CDSNQ15517 529 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TEX45Q8NA69 505 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 NECAP1Q8NC96 275 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR5T1Q8NG75 326 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 RNF2Q99496 336 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C12orf57Q99622 126 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SSX3Q99909 188 aa6.68□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PPP1R2P9O14990 202 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR7C2O60412 319 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 LINC00869P0C866 280 aa6.67□□□□□ -1.34
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