RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MED22Q15528 200 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PVRIGQ6DKI7 326 aa4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.87□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 FCGR3BO75015 233 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HRASP01112 189 aa4.86□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM231CP0DMU5 169 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CD36P16671 472 aa4.86□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 PLA2G7Q13093 441 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.86□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF773Q6PK81 442 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PLET1Q6UQ28 207 aa4.86□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SSX9Q7RTT3 188 aa4.86□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 RNF2Q99496 336 aa4.86□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IGLL5B9A064 214 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 HLA-DMBP28068 263 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PSMD7P51665 324 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 TAS2R31P59538 309 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM187Q14656 261 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KIR3DS1Q14943 382 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SPHARQ15513 63 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RAB11BQ15907 218 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 Q6ZTC4 211 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 Q8N1X5 172 aa4.85□□□□□ -1.63
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SOX9-AS1-218ENST00000628742 CYGBQ8WWM9 190 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MND1Q9BWT6 205 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 S100A14Q9HCY8 104 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FBXL17Q9UF56 701 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 S4R3C0 116 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.85□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DPPA5A6NC42 116 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR2T8A6NH00 312 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 UPK2O00526 184 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MYL12BO14950 172 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CIB2O75838 187 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARL6IP5O75915 188 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARL6IP1Q15041 203 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRAM1Q15629 374 aa4.84□□□□□ -1.63
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C12orf74Q32Q52 190 aa4.84□□□□□ -1.63
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