RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	MMP23A	O75900	390 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	BRS3	P32247	399 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	GLRX	P35754	106 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	GALR1	P47211	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	GNB2	P62879	340 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0U1RQK1	487 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	YPEL1	O60688	119 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	NPPC	P23582	126 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	RND1	Q92730	232 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	OR5B12	Q96R08	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TCF19	Q9Y242	345 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	NDUFB4	O95168	129 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	SELENOV	P59797	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	RELB	Q01201	579 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TM4SF5	O14894	197 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	GFRA3	O60609	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	RND2	P52198	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341		Q8N7P7	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	BSN	Q9UPA5	3926 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	C20orf202	A1L168	122 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	MGST2	Q99735	147 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ACTL6B	O94805	426 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	PAX5	Q02548	391 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TACC2	O95359	2948 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ABCA1	O95477	2261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM250	H0YL14	139 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	AMBP	P02760	352 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	C22orf46	C9J442	243 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	PPP5D1	E7EU14	171 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341		Q6ZVH6	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	F2RL2	O00254	374 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	REG1B	P48304	166 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	GNB1	P62873	340 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS8	Q16651	343 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	CSTL1	Q9H114	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	DVL1	O14640	695 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	LHB	P01229	141 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	C1QTNF9	P0C862	333 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF114	Q8NC26	417 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	CEACAM4	O75871	244 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	CA2	P00918	260 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	CD40	P25942	277 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	RNF2	Q99496	336 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	ABCA4	P78363	2273 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	PTPRB	P23467	1997 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	NPY1R	P25929	384 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	FAM78B	Q5VT40	261 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SMTN-222	ENST00000612341	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		10.58	□□□□□ -0.72

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