RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.06□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 C15orf61A6NNL5 157 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 UPK2O00526 184 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 ATP6V0E1O15342 81 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SFT2D2O95562 160 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 CDS2O95674 445 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 KRASP01116 189 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 HLA-GP17693 338 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 G6PCP35575 357 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 CX3CL1P78423 397 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM187Q14656 261 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 FXYD3Q14802 87 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 C4orf46Q504U0 113 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM268Q5VZI3 342 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 PLET1Q6UQ28 207 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 GRPEL2Q8TAA5 225 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SEC22AQ96IW7 307 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 CLCC1Q96S66 551 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 PHB2Q99623 299 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 COMMD5Q9GZQ3 224 aa10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 A0A0B4J2A0 478 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 PRAF2O60831 178 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 ELANEP08246 267 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 OR4E1P0C645 316 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 NDPQ00604 133 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 IFITM3Q01628 133 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 FOXE3Q13461 319 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 PPP1R1AQ13522 171 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 ECSCRQ19T08 205 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 LYG2Q86SG7 212 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF429Q86V71 674 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 LRTM2Q8N967 370 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 OR5B3Q8NH48 314 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 OR4A16Q8NH70 328 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 PDCD10Q9BUL8 212 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SORL1Q92673 2214 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 H3BUA1 57 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 IGKV1-39P01597 117 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 IGKV1D-39P04432 117 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 OR8U8P0C7N1 319 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 DHRS2Q13268 280 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 DEFB136Q30KP8 78 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 SP6Q3SY56 376 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.03□□□□□ -0.8
FCHO1-225ENST00000598539 TNCP24821 2201 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 C9orf170A2RU37 121 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 IGKV1-5P01602 117 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 P0C879 139 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 SLC35G3Q8N808 338 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 IL17DQ8TAD2 202 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 TMED3Q9Y3Q3 217 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 OR51B2Q9Y5P1 312 aa10.02□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 A0A1W2PN81 502 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 FCN1O00602 326 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 CYB5BO43169 146 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 DHFRP00374 187 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 IL5P05113 134 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 OR9G9P0C7N8 305 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 SULT1A3P0DMM9 295 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 SULT1A4P0DMN0 295 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 CHRNA7P36544 502 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 OR2B8PP59922 312 aa10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
FCHO1-225ENST00000598539 CFHR3Q02985 330 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms