RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF695Q8IW36 515 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8G5Q8NG78 346 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SUN5Q8TC36 379 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RDH5Q92781 318 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IL22RA2Q969J5 263 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL11Q969Q4 196 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 C18orf12Q96KH6 178 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF488Q96MN9 340 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF126Q9BV68 326 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 REG4Q9BYZ8 158 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ASF1BQ9NVP2 202 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TREM2Q9NZC2 230 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GLS2Q9UI32 602 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGF2RP11717 2491 aa3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RTTNQ86VV8 2226 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB19A4D1S5 217 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5H1A6NKK0 313 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 H0Y980 276 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX46H3BTG2 121 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SIRPB1O00241 398 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CDIPTO14735 213 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD17B6O14756 317 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF16O43320 207 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM50AO95807 157 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2H2O95918 312 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 HAND1O96004 215 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV1-44P01699 117 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV2-11P01706 119 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CECR9P0C854 216 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF250P15622 560 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 M6PRP20645 277 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GNRHRP30968 328 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MPV17P39210 176 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNJ3P48549 501 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVS71-1P61550 626 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVK11-1P61568 191 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GNMTQ14749 295 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 HERPUD1Q15011 391 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SP6Q3SY56 376 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF876PQ49A33 203 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR157Q5UAW9 335 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6P435 159 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZS92 163 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR86Q86TI4 376 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GAPTQ8N292 157 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 STPG2Q8N412 459 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35G3Q8N808 338 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 NRGNQ92686 78 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM56Q96MV1 263 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00052Q96N35 136 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TP53RKQ96S44 253 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CLCC1Q96S66 551 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP26Q9NRE1 261 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM100Q9NV29 134 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 KNTC1P50748 2209 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ITPR3Q14573 2671 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ZZEF1O43149 2961 aa3.29□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF3C1Q12789 2109 aa3.28□□□□□ -1.88
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms