RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 APOA1P02647 267 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 CD24P25063 80 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-3P60369 221 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 HERPUD1Q15011 391 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF575Q86XF7 245 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8N2B8 174 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 UBALD1Q8TB05 177 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 DDB2Q92466 427 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 TOMM40LQ969M1 308 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 PTX4Q96A99 478 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 KCTD7Q96MP8 289 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 YPEL2Q96QA6 119 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 MGAT4AQ9UM21 535 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PPV4 95 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 NAPSAO96009 420 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 CD36P16671 472 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 GNG10P50151 68 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 EBI3Q14213 229 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ARL6IP1Q15041 203 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 NFE4Q86UQ8 179 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 DRAM1Q8N682 238 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 PECRQ9BY49 303 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR51E2Q9H255 320 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF702PQ9H963 129 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 AK3Q9UIJ7 227 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 DNHD1Q96M86 4753 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 G3V4G9 280 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD17B6O14756 317 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 TNFAIP8O95379 198 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 TOMM40O96008 361 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 CD3GP09693 182 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 GADD45AP24522 165 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 CEACAM6P40199 344 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 BCAP31P51572 246 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10A3P58181 314 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 HES1Q14469 280 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 HMGN3Q15651 99 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 NEDD8Q15843 81 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 CDNFQ49AH0 187 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB3CQ96E17 227 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 RCHY1Q96PM5 261 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 JPT1Q9UK76 154 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 TRDCB7Z8K6 153 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGB1BP1O14713 200 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC31A2O15432 143 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 FGF16O43320 207 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 MOSP00540 346 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1D-33P01593 117 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1-33P01594 117 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 MBP02144 154 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 SCTP09683 121 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB25P24278 435 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 FCGR2CP31995 323 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 SDC2P34741 201 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 TALDO1P37837 337 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 REG1BP48304 166 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF137PP52743 207 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 XGP55808 180 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 LYG1Q8N1E2 194 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 OR56B4Q8NH76 319 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-216ENST00000590105 CYYR1Q96J86 154 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms