RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 VSIRQ9H7M9 311 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 A0A0A6YYD4 124 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 A0A1W2PPQ1 181 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 K7EQG2 157 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 OGG1O15527 345 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CTSGP08311 255 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ZNF688P0C7X2 276 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 HAMPP81172 84 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SLC29A1Q99808 456 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GINS4Q9BRT9 223 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GINS3Q9BRX5 216 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 Q9H3A6 140 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SOCS1O15524 211 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 DIRAS3O95661 229 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 LIMS3P0CW19 117 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 LIMS4P0CW20 117 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GNRHRP30968 328 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ERVFC1-1P60608 527 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 UNC119Q13432 240 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CLINT1Q14677 625 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SSX1Q16384 188 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TTC23Q5W5X9 447 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SSX7Q7RTT5 188 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 RAB40CQ96S21 281 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 KCNK15Q9H427 330 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 HSF4Q9ULV5 492 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 HRASP01112 189 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 OR13C7P0DN81 318 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TAS2R43P59537 309 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 FLOT2Q14254 428 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CBR4Q8N4T8 237 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 FAM107BQ9H098 131 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 AMBNQ9NP70 447 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 BET1LQ9NYM9 111 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 J3QRK9 145 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 K7EIM0 57 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SERPINE2P07093 398 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CD36P16671 472 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ALDH3B2P48448 385 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ZNF773Q6PK81 442 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 DERL3Q96Q80 235 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 PECRQ9BY49 303 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 F5H768 121 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 BPNT1O95861 308 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 OXTP01178 125 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 CDK1P06493 297 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 GCSHP23434 173 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 DCKP27707 260 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 TMEM50BP56557 158 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 LINC00315P59091 139 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 QRFPP83859 136 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 WT1-ASQ06250 92 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 RCN1Q15293 331 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 PSMG4Q5JS54 123 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-212ENST00000582376 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms