RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567954.5

LYRM1-208, Transcript of LYR motif containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYRM1, Length 460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM1-208	ENST00000567954	PSG9	Q00887	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954		J3QRK9	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	OGG1	O15527	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	KBTBD11	O94819	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	HMGN1	P05114	100 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	PTMS	P20962	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	PAX9	P55771	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	B2M	P61769	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	RCN1	Q15293	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	S100A13	Q99584	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954		K7EIM0	57 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CCNK	O75909	580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	NPPC	P23582	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	TNFSF8	P32971	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	P2RY1	P47900	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954		Q9HAA7	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954		H3BN98	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CCNB2	O95067	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ELK1	P19419	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	RAB3A	P20336	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF79	Q15937	498 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	RAB27B	O00194	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	HLA-G	P17693	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	CRYBB3	P26998	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	DEFB1	P60022	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	PSME3	P61289	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	GPR176	Q14439	515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	GINS1	Q14691	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954		Q8N976	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LYRM1-208	ENST00000567954	TXN2	Q99757	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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