RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCO2A0A1W2PP80 73 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 J3QR06 171 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VENTXO95231 258 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CXorf1O96002 111 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STAG3L2P0CL84 134 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STAG3L3P0CL85 134 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGFBP2P18065 325 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCKARP32238 428 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XKRY2A2RUG3 117 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FOXH1O75593 365 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMPRSS3P57727 454 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RAB31Q13636 194 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CT45A6P0DMU7 189 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CT45A5P0DMU8 189 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CT45A7P0DMV0 189 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 REG1BP48304 166 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EFNB3Q15768 340 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF439Q8NDP4 499 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR4P4Q8NGL7 312 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DYSFO75923 2080 aa10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ITGB1BP1O14713 200 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR4A8P0C604 315 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCL3L1P16619 93 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRSS8Q16651 343 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RTL8BQ17RB0 113 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0G2JNJ9 132 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 hADV38S2A0JD32 116 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F6UZH7 168 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RHOBP62745 196 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL31P62899 125 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q9UFV3 132 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BSNQ9UPA5 3926 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF320A2RRD8 509 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf97H3BN30 126 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GCHFRP30047 84 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTCAP3Q53RY4 240 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCL17Q92583 94 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRNDQ9UKY0 176 aa10.15□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MUC6Q6W4X9 2439 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLEQ07864 2286 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRRG2O14669 202 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CASP6P55212 293 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BSPH1Q075Z2 132 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAMTQ14353 236 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SSX2Q16385 188 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MLANAQ16655 118 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DOLPP1Q86YN1 238 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR1P1Q8NH06 330 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SVIPQ8NHG7 77 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KALRNO60229 2985 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DPRXA6NFQ7 191 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNFRSF1AP19438 455 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL3RAP26951 378 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFA6Q01524 100 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADIPOQQ15848 244 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MIR17HGQ75NE6 70 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABHD17AQ96GS6 310 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SFRP2Q96HF1 295 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.14□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TANC2Q9HCD6 1990 aa10.13□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPTA1P02549 2419 aa10.13□□□□□ -0.79
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MKRN2OSH3BPM6 223 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms