RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560311.1

IRF9-208, Transcript of interferon regulatory factor 9, human

TSL 2

Gene IRF9, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF9-208	ENST00000560311	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	TG	P01266	2768 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311		E7EUB6	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311		M0QYG6	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	BMPR1B	O00238	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	GPR31	O00270	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	HPRT1	P00492	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	REG1A	P05451	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	GP9	P14770	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	RPA2	P15927	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	NQO2	P16083	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	SPN	P16150	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	PSMB6	P28072	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	GNRHR	P30968	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	OR2B8P	P59922	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	ERVK-16	P61578	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	RYR2	Q92736	4967 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.96	□□□□□ -1.61
IRF9-208	ENST00000560311	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	UPK2	O00526	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	DHFR	P00374	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CRYGC	P07315	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	FGF2	P09038	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CTRB1	P17538	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	F2R	P25116	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	PPP5C	P53041	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TSPAN5	P62079	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311		H3BMQ9	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	RGS5	O15539	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	NDUFB8	O95169	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	CD3D	P04234	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	DEFA4	P12838	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	TBP	P20226	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	S100G	P29377	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	G6PC	P35575	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	LPAR6	P43657	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IRF9-208	ENST00000560311	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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