RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	PLXNB1	O43157	2135 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	AP4M1	O00189	453 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	ACTL6B	O94805	426 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	KBTBD11	O94819	623 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	NUDT3	O95989	172 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	PTTG1	O95997	202 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	KRAS	P01116	189 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	IGF1	P05019	195 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	MAS1L	P35410	378 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM16L	Q309B1	348 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	OR4A47	Q6IF82	309 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	PLET1	Q6UQ28	207 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	FAM219A	Q8IW50	185 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01006	Q8NI28	216 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	SEC22A	Q96IW7	307 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM56	Q96MV1	263 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0B4J2A0	478 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf170	A2RU37	121 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	SFT2D2	O95562	160 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	CA2	P00918	260 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV1-39	P01597	117 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV1D-39	P04432	117 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	OR4E1	P0C645	316 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	G6PC	P35575	357 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	AKR1C2	P52895	323 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	CX3CL1	P78423	397 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	PPP1R1A	Q13522	171 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM187	Q14656	261 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	PRSS8	Q16651	343 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	SP6	Q3SY56	376 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	SSX9	Q7RTT3	188 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF695	Q8IW36	515 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	LGI3	Q8N145	548 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	LRTM2	Q8N967	370 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	GON7	Q9BXV9	100 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	OR51J1	Q9H342	316 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.9	□□□□□ -1.46
NUMB-231	ENST00000559312	UPK2	O00526	184 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	FCN1	O00602	326 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	PRAF2	O60831	178 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SNAPC5	O75971	98 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312		P0C879	139 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	VDAC1	P21796	283 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	RAB25	P57735	213 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	DHRS2	Q13268	280 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	FXYD3	Q14802	87 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	C4orf46	Q504U0	113 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	LYG2	Q86SG7	212 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	STPG2	Q8N412	459 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OR5B3	Q8NH48	314 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	ARPC1A	Q92747	370 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM68	Q96MH6	324 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CLCC1	Q96S66	551 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SPIN2A	Q99865	258 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		5.9	□□□□□ -1.47

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