RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 HOGA1Q86XE5 327 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PDPNQ86YL7 162 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR11H1Q8NG94 326 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR52I2Q8NH67 350 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ISOC1Q96CN7 298 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RNF183Q96D59 192 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 KLK11Q9UBX7 282 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CXorf65A6NEN9 183 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PPP5D1E7EU14 171 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CCL24O00175 119 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 XRCC3O43542 346 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PAGE4O60829 102 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SAP30O75446 220 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR2J3O76001 311 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SCGNO76038 276 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 KBTBD11O94819 623 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CD3DP04234 171 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 AREGP15514 252 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PSMB8P28062 276 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RCVRNP35243 200 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 G6PCP35575 357 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ALDH3B2P48448 385 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RORCP51449 518 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PITPNAQ00169 270 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 NPBQ8NG41 125 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR4S2Q8NH73 311 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MCFD2Q8NI22 146 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PTX4Q96A99 478 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM68Q96MH6 324 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0A0MQY5 61 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1B0GW64 132 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MSGN1A6NI15 193 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CBY3A6NI87 242 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 E7EUB6 86 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RBBP9O75884 186 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TOMM40O96008 361 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 KRASP01116 189 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV3-48P01763 117 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHG4P01861 327 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-DQB1P01920 261 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 APOA1P02647 267 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IFNA6P05013 189 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MC5RP33032 325 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RANBP1P43487 201 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RAB9AP51151 201 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TAS2R46P59540 309 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF45Q02386 682 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF616Q08AN1 781 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CATR1Q13166 79 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ARL6IP1Q15041 203 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TWIST1Q15672 202 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS8Q16651 343 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SP6Q3SY56 376 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR4A47Q6IF82 309 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 FAM219AQ8IW50 185 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 POC5Q8NA72 575 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms