RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SLC22A5	O76082	557 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TPPP	O94811	219 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	KRAS	P01116	189 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PRH1	P02810	166 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CRYGB	P07316	175 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR5AC1	P0C628	307 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RRAS	P10301	218 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	AKR1C4	P17516	323 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF45	Q02386	682 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FXYD3	Q14802	87 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TRIM16L	Q309B1	348 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF585B	Q52M93	769 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SPINK9	Q5DT21	86 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR4A47	Q6IF82	309 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	POC5	Q8NA72	575 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR5T1	Q8NG75	326 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TERB2	Q8NHR7	220 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TMEM230	Q96A57	120 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PRRT1	Q99946	306 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688		E7EUB6	86 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PLA2G10	O15496	165 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	KBTBD11	O94819	623 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR2A4	O95047	310 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SPDEF	O95238	335 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	HPRT1	P00492	218 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IGKV1-39	P01597	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IGKV1D-39	P04432	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	REG1A	P05451	166 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CSN3	P07498	182 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR9G9	P0C7N8	305 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	F2R	P25116	425 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	S100G	P29377	79 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	BTC	P35070	178 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	KIR2DS2	P43631	304 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	UCP3	P55916	312 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	AP3S2	P59780	193 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	UBE2K	P61086	200 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ERVK-16	P61578	105 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IFITM3	Q01628	133 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF846	Q147U1	533 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PRSS8	Q16651	343 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR2A7	Q96R45	310 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	HINT2	Q9BX68	163 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NAA60	Q9H7X0	242 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688		A0A0G2JRQ6	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GW64	132 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	MSGN1	A6NI15	193 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	DBX1	A6NMT0	343 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	MARCH11	A6NNE9	402 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	LYRM1	O43325	122 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ACTL6B	O94805	426 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	HRAS	P01112	189 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SERPINE2	P07093	398 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NQO2	P16083	231 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	LGALS7	P47929	136 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	AKR1C2	P52895	323 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SYNJ2BP	P57105	145 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CD81	P60033	236 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	MSMO1	Q15800	293 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RPEL1	Q2QD12	228 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FAM219A	Q8IW50	185 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TEX45	Q8NA69	505 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58

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