RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1B0GUL6	1792 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	DPRX	A6NFQ7	191 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		H3BMG7	143 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		K7ENP7	123 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GYPA	P02724	150 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CD70	P32970	193 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GFER	P55789	205 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		Q0VG73	95 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RLF	Q13129	1914 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		C9JQL5	133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	HLA-DOA	P06340	250 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NEURL3	Q96EH8	262 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	DSCR8	Q96T75	97 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RBAKDN	A6NC62	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ANGPTL7	O43827	346 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	YPEL1	O60688	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	EPPIN	O95925	133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CSN1S1	P47710	185 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC00311	Q8N616	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	VOPP1	Q96AW1	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	YPEL2	Q96QA6	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		V9GY05	133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SIPA1L1	O43166	1804 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		A8MWL6	223 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C11orf98	E9PRG8	122 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MGST3	O14880	152 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PITX3	O75364	302 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	WISP2	O76076	250 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CBLN1	P23435	193 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP4B	P51164	291 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	DAD1	P61803	113 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FUT5	Q11128	374 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLK5	Q496M5	336 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LCN8	Q6JVE9	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LMX1A	Q8TE12	382 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SPRY4	Q9C004	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PROSC	O94903	275 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CD59	P13987	128 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PIP4P1	Q86T03	277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	IRGM	A1A4Y4	181 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PRH1	P02810	166 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	IL5	P05113	134 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ASIP	P42127	132 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		3.12	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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