RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 DEFB135Q30KP9 77 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 PLET1Q6UQ28 207 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 OR4A5Q8NH83 315 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 GFI1Q99684 422 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 SCN3BQ9NY72 215 aa5.67□□□□□ -1.5
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C16orf62-212ENST00000540240 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.67□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 PTGES3LE9PB15 166 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 MFNGO00587 321 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 PDCD5O14737 125 aa5.66□□□□□ -1.5
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C16orf62-212ENST00000540240 HLA-DQB1P01920 261 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 DTYMKP23919 212 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 CRHBPP24387 322 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 CLDN12P56749 244 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 RAP2BP61225 183 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 IRF3Q14653 427 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM203Q969S6 136 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 ATP6V0BQ99437 205 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.66□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 A0A075B6Q4 140 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 E7EUB6 86 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 K7EMT4 169 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 RAB27BO00194 218 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 FGF2P09038 288 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 AREGP15514 252 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 GNB3P16520 340 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 HLA-GP17693 338 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 HES5Q5TA89 166 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 CNIH2Q6PI25 160 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 C2CD4CQ8TF44 421 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 RARRES2Q99969 163 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 CSTL1Q9H114 145 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 BET1LQ9NYM9 111 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 S4R3C0 116 aa5.65□□□□□ -1.5
C16orf62-212ENST00000540240 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 IFITM5A6NNB3 132 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 MPTX1A8MV57 137 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 C11orf94C9JXX5 98 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 J3QRK9 145 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 TGOLN2O43493 480 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 GNAO1P09471 354 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 HSMCR30P0CW71 290 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 GPR183P32249 361 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 RCN1Q15293 331 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 MSMO1Q15800 293 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 CT83Q5H943 113 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 VCXQ9H320 206 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 HRASLSQ9HDD0 168 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 SPATA2Q9UM82 520 aa5.64□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.63□□□□□ -1.51
C16orf62-212ENST00000540240 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.63□□□□□ -1.51
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