RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 NXPH3O95157 252 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 CEACAM3P40198 252 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 PRR27Q6MZM9 219 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 FOXC2Q99958 501 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 SERPINE3A8MV23 424 aa7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-202ENST00000538886 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 CFAP161Q6P656 301 aa7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-202ENST00000538886 BIVMQ86UB2 503 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 SLC35E1Q96K37 410 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 Q96M66 194 aa7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-202ENST00000538886 FUT9Q9Y231 359 aa7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-202ENST00000538886 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-202ENST00000538886 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
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GGA3-202ENST00000538886 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.22□□□□□ -1.25
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GGA3-202ENST00000538886 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-202ENST00000538886 H3BUX3 64 aa7.21□□□□□ -1.26
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GGA3-202ENST00000538886 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.21□□□□□ -1.26
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GGA3-202ENST00000538886 GPR137BO60478 399 aa7.21□□□□□ -1.26
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GGA3-202ENST00000538886 TAS2R46P59540 309 aa7.21□□□□□ -1.26
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GGA3-202ENST00000538886 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 GNG13Q9P2W3 67 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 KRASP01116 189 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 HLA-DRB3P79483 266 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 DNLZQ5SXM8 178 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 LFNGQ8NES3 379 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-202ENST00000538886 OR4X1Q8NH49 305 aa7.2□□□□□ -1.26
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