RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 C15orf62A8K5M9 175 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGLL5B9A064 214 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 K7EMT4 169 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TNFSF12O43508 249 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 HPRT1P00492 218 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGLV2-14P01704 120 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 RAB3BP20337 219 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 ERVK-16P61578 105 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 MSMO1Q15800 293 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 Q56UQ5 140 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 EBAG9O00559 213 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 XRCC3O43542 346 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 YIF1AO95070 293 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 CD5P06127 495 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 FGF2P09038 288 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 OR13C7P0DN81 318 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TFPI2P48307 235 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 MFAP2P55001 183 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 OR10A3P58181 314 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM187Q14656 261 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 BORCS5Q969J3 196 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 MGLLQ99685 303 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM235A6NFC5 223 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 SULT1C2O00338 296 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 UPK2O00526 184 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 S1PR2O95136 353 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 SERPINE2P07093 398 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 HINT2Q9BX68 163 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM140Q9NV12 185 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 CGB1A6NKQ9 187 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 MED14OSP0DP75 135 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 FCGR2CP31995 323 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 PRR20EP86478 221 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 PRR20CP86479 221 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 PRR20DP86480 221 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 PRR20BP86481 221 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 PRR20AP86496 221 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 POU2AF1Q16633 256 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 GPHA2Q96T91 129 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 RNF2Q99496 336 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 GINS3Q9BRX5 216 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 HRH4Q9H3N8 390 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 COMMD9Q9P000 198 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 SMPXQ9UHP9 88 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 DEFB4AO15263 64 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 SNAPC5O75971 98 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 FXYD4P59646 89 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 STHQ8IWL8 128 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 BEST4Q8NFU0 473 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 OR51H1Q8NH63 302 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM56Q96MV1 263 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 DUSP21Q9H596 190 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 ETV7Q9Y603 341 aa8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CMTM1-211ENST00000528484 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.46□□□□□ -1.06
CMTM1-211ENST00000528484 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.46□□□□□ -1.06
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