RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 IGSF23A1L1A6 192 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 BCL2L11O43521 198 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 FSHBP01225 129 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 OPN1MWP04001 364 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 NHLH2Q02577 135 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 BAXQ07812 192 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 AANATQ16613 207 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 STX12Q86Y82 276 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1W2PN81 502 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 H3BP45 60 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CD5LO43866 347 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CST7O76096 145 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 IFNA10P01566 189 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 MYOD1P15172 320 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CHRNA7P36544 502 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SULT1A1P50225 295 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 TNXAQ16473 311 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SLC51BQ86UW2 128 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SSX3Q99909 188 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 U3KQ87 197 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 FCN1O00602 326 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 GNB1P62873 340 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 FBLN7Q53RD9 439 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 PIFOQ8TCI5 191 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 OR4C12Q96R67 309 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 FBXL17Q9UF56 701 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 PDZD2O15018 2839 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CGB1A6NKQ9 187 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 JTBO76095 146 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CNIH1O95406 144 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CA2P00918 260 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SNCAP37840 140 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 HTR2BP41595 481 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 RAB11AP62491 216 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 HBG1P69891 147 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 HBG2P69892 147 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 IFITM2Q01629 132 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 Q8N9W7 124 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 CR1P17927 2039 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 A6NDX4 124 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 C15orf62A8K5M9 175 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 E7EUB6 86 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 F8W735 103 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-210ENST00000519815 H3BUX3 64 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms