RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 VSIG2Q96IQ7 327 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf50Q96LR7 162 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRRC1Q96M27 445 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00052Q96N35 136 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZIM3Q96PE6 472 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 FANCD2OSQ96PS1 177 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 YPEL2Q96QA6 119 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL26Q96S19 204 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAFAH2Q99487 392 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A31Q9H0C2 315 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPYL1Q9H0U9 437 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35B3Q9H1N7 401 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIBC2Q9H4K1 309 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCPEP1Q9HB40 452 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAF9BQ9HBM6 251 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 AP5S1Q9NUS5 200 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL8BQ9NVJ2 186 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERVK13-1Q9NX77 482 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 C21orf62Q9NYP8 219 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 DOK5Q9P104 306 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABRACLQ9P1F3 81 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMP5Q9UJQ1 280 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNX24Q9Y343 169 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 V9GYS6 101 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCRIP1C9JLW8 97 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 E5RGE8 158 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 M0R1X1 148 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC17A2O00624 439 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARPC3O15145 178 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNG7O60262 68 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNX3O60493 162 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGB2A1O75556 95 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAPSAO96009 420 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNGP01579 166 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEC11BP0C7V7 166 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM18P0DKX4 95 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CT45A10P0DMU9 189 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRASP10301 218 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD36P16671 472 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 LBPP18428 481 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PI3P19957 117 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFRSF1BP20333 461 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ID1P41134 155 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ETV6P41212 452 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 YAP1P46937 504 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTPNP58546 118 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R60P59551 318 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTR3P61158 418 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL19P84098 196 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRCDQ00LT1 54 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FHL1Q13642 323 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL13RA2Q14627 380 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK10Q15131 360 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2V2Q15819 145 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 C4orf48Q5BLP8 95 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf55Q5SWW7 151 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDI2Q5TDH0 399 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A24Q6NUK1 477 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXI2Q6ZQN5 318 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00173Q6ZV60 143 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM219AQ8IW50 185 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAXO1Q8IYX7 474 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF709Q8N972 641 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf163Q8N9P6 203 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NHLRC2Q8NBF2 726 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10A6Q8NH74 314 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCANP1Q8TF63 244 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PP6455Q8WZ26 134 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTX4Q96A99 478 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPSB1Q96BD6 273 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MOB3AQ96BX8 217 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABHD14BQ96IU4 210 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPD52L3Q96J77 140 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10C1Q96KK4 312 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 C16orf92Q96LL3 132 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OPALINQ96PE5 141 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V0BQ99437 205 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPER1Q99527 375 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100A13Q99584 98 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 RETNLBQ9BQ08 111 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 THTPAQ9BU02 230 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC28BQ9BUN5 200 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFI27L2Q9H2X8 130 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52D1Q9H346 318 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPDPFQ9H3Y8 114 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 VSIRQ9H7M9 311 aa1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms