RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACOX3O15254 700 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-397P-201ENST00000516226 MIFP14174 115 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPI1P17947 270 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-397P-201ENST00000516226 PSMD7P51665 324 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-397P-201ENST00000516226 SMIM12Q96EX1 92 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-397P-201ENST00000516226 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-397P-201ENST00000516226 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-397P-201ENST00000516226 UBL3O95164 117 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-397P-201ENST00000516226 SSR2P43308 183 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 HLA-DRB3P79483 266 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-397P-201ENST00000516226 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-397P-201ENST00000516226 METTL15A6NJ78 407 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 LYZL6O75951 148 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 APOMO95445 188 aa-0.81□□□□□ -2.54
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RNU6-397P-201ENST00000516226 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
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RNU6-397P-201ENST00000516226 PRRG3Q9BZD7 231 aa-0.81□□□□□ -2.54
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RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR54Q9H977 334 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 C5orf49A4QMS7 147 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 SULT1B1O43704 296 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC00614P0C842 121 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 STAG3L2P0CL84 134 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 FGF6P10767 208 aa-0.82□□□□□ -2.54
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