RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 COQ4Q9Y3A0 265 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-220ENST00000512069 MED12LQ86YW9 2145 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 A0A087WUJ7 227 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 A0A0B4J2E0 115 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1B0GX12 115 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC30A6NM36 301 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF726A6NNF4 738 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 DEGS1O15121 323 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ICOSLGO75144 302 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 IGHV3-48P01763 117 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 PSG2P11465 335 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SPNP16150 400 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 VDAC1P21796 283 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 CRHBPP24387 322 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 KDELR1P24390 212 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GRPRP30550 384 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 NTSP30990 170 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 BDKRB1P46663 353 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GABRA2P47869 451 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 EFNB2P52799 333 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 AQP4P55087 323 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 DLX6P56179 175 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 OR10A3P58181 314 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TAS2R30P59541 319 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 RHOBP62745 196 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 CDK5Q00535 292 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 PLCXD2Q0VAA5 305 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 OR2F1Q13607 317 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GNMTQ14749 295 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 PEA15Q15121 130 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TAL2Q16559 108 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TBC1D28Q2M2D7 210 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF404Q494X3 552 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 OR10J3Q5JRS4 329 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SOHLH1Q5JUK2 328 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 CPTPQ5TA50 214 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 PVRIGQ6DKI7 326 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ENPP6Q6UWR7 440 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TOMM20LQ6UXN7 152 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 MUC15Q8N387 334 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 CHST4Q8NCG5 386 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GPR32P1Q8NGA4 272 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 OR5AU1Q8NGC0 362 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 OR10G4Q8NGN3 311 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SYNPRQ8TBG9 265 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GPR119Q8TDV5 335 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ARL11Q969Q4 196 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 PTX4Q96A99 478 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 RCN3Q96D15 328 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GPR82Q96P67 336 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 NRTNQ99748 197 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GINS3Q9BRX5 216 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF649Q9BS31 505 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM126AQ9H061 195 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SRMSQ9H3Y6 488 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ENY2Q9NPA8 101 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 UBQLN4Q9NRR5 601 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SPANXCQ9NY87 97 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ST3GAL6Q9Y274 331 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 VWFP04275 2813 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 NACAE9PAV3 2078 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 PRR14LQ5THK1 2151 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 A0A087WX48 190 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 A0A096LNT2 108 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 A0A0A6YYD5 115 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1W2PRE2 83 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 COLCA2A8K830 154 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 DEFB108AA8MXU0 73 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SIRPB1O00241 398 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.969e-9■■■■■ 31.4
PDE4D-220ENST00000512069 HPRT1P00492 218 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 MT-ND4LP03901 98 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 P04436 131 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 ESDP10768 282 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 TAC1P20366 129 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 MYL9P24844 172 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 HTR1DP28221 377 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 CMPK1P30085 196 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-220ENST00000512069 SPINT3P49223 89 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms