RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-208ENST00000506437 UBALD1Q8TB05 177 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PTX4Q96A99 478 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 NSG2Q9Y328 171 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PPIAL4DF5H284 164 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IGHV3-13P01766 116 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 FAM78BQ5VT40 261 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MEGF11A6BM72 1044 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 EGR1P18146 543 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SELENOVP59797 346 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 GNG3P63215 75 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RELBQ01201 579 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 BSXQ3C1V8 233 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SFRP2Q96HF1 295 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 Q9N2K0 584 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 J3QKU1 62 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 HRASP01112 189 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 KITLGP21583 273 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TPPP2P59282 170 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LCN12Q6JVE5 192 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 FGFRL1Q8N441 504 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RDH5Q92781 318 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 UHRF2Q96PU4 802 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR51I2Q9H344 312 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 VSIRQ9H7M9 311 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TAX1BP3O14907 124 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 AZU1P20160 251 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PPOXP50336 477 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MPV17L2Q567V2 206 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 Q6ZSR3 168 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR4S2Q8NH73 311 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SPSB1Q96BD6 273 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 METRNQ9UJH8 293 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RNF212BA8MTL3 300 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 KRTAP10-9P60411 292 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 QRFPP83859 136 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PAX2Q02962 417 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SIRPB1O00241 398 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 BCL2P10415 239 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 GPR157Q5UAW9 335 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 NUP37Q8NFH4 326 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 LRRC29Q8WV35 223 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 THYN1Q9P016 225 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 A0A1B0GV72 72 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 IGSF23A1L1A6 192 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM50BP56557 158 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PSG9Q00887 426 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 MSMO1Q15800 293 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 WDR82Q6UXN9 313 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 NRN1Q9NPD7 142 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 ST8SIA3O43173 380 aa9.46□□□□□ -0.89
ITGA3-208ENST00000506437 AMY2BP19961 511 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms